Генетический анализатор SOLID™ - последняя революционная разработка компании Applied Biosystems. Система высокоскоростного автоматического полногеномного секвенирования, основанная на новейших методах молекулярной биологии – эмульсионной ПЦР и твердофазном лигировании. SOLID (Sequencing by Oligonucleotide Ligation and Detection) – технология параллельного секвенирования на основе лигазной цепной реакции (лигирование флуоресцентно меченых олигонуклеотидов).

КЛЮЧЕВЫЕ ОСОБЕННОСТИ

• Высокая точность – 99.99% с модулем Exact Call Chemistry (ECC). Обнаружение важных мутаций при небольшой кратности покрытия и стоимости эксперимента
• Высокая производительность: за прогон -
  по кол-ву образцов - от 1 до 576 / 1152
  по кол-ву оснований – 90 млрд / 180 - 300 млрд, в день, п.н. – 15 млрд / 20 - 45 млрд.
• Длина прочтения, п.н.: 35, 75, 75+35, 2x60
• Гибкость, позволяющая получать минимальную стоимость при разных задачах благодаря возможности проводить частичный запуск прибора (использование 1-6/1-12 дорожек проточной ячейки)
• интегрированная компьютерная система с возможностью анализа данных в режиме реального времени
• широкий спектр программного обеспечения
• поддержка мультиплексного анализа при помощи штрих-кодирования

SOLiD работает с геномами растений, людей, бактерий, дрожжей, животных, вирусов как на уровне ДНК, так и РНК.

SOLID™ ПОЗВОЛЯЕТ ПРОВОДИТЬ:

• Исследования геномов:
  Полное повторное секвенирование геномов (поиск SNP, структурных перестроек и вариаций, полногеномное генотипирование);
  Направленное повторное секвенирование отдельных крупных фрагментов геномов;
  de novo секвенирование небольших геномов (вирусы, микроорганизмы)
• Анализ РНК (RNA-Seq):
  Изучение малых РНК (miRNA, siRNA, piRNA, esiRNA);
  Измерение уровней мРНК, анализ изоформ мРНК, изучение некодирующих РНК, детекция новых транскриптов;
  Анализ экспрессии генов в отдельной клетке;
  Изучение РНК-белковых взаимодействий
• Эпигенетические исследования:
  Иммунопреципитация хроматина с последующим секвенированием (ChIP-Seq);
  Анализ статуса метилирования ДНК в полногеномном масштабе (MeDIP-Seq).
  Профилирование рибосом:
  Измерение уровня трансляции тысяч мРНК одновременно;
  Изучение механизмов трансляционного контроля.